Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN1Q04323 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms