Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms