Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
E2F1Q01094 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms