Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms