Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVPABLB-1P60509 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms