Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATRXP46100 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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