Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AFMP43652 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFMP43652 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms