Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC1P41238 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms