Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM5CP41229 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5CP41229 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms