Protein–RNA interactions for Protein: P34897

SHMT2, Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHMT2P34897 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SHMT2P34897 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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