Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA3P32297 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms