Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMB4P28070 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms