Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGS1P23219 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms