Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB1P16220 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms