Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms