Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms