Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms