Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBF4Q9UBU7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms