Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms