Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN10Q9UBB4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms