Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms