Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RRBP1Q9P2E9 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms