Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms