Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCC13Q9NSE7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms