Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT82Q9NSB4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms