Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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