Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLMQ9NP87 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms