Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms