Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms