Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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