Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM4Q9C037 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms