Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FOLR1-203ENST00000393679 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 NBR2-202ENST00000460115 1344 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CACNA1C-AS1-203ENST00000544517 742 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FXYD3-210ENST00000604621 548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AL590491.2-202ENST00000611126 418 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms