Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PLVAPQ9BX97 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLVAPQ9BX97 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms