Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms