Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMM29Q9BSF4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms