Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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