Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MGME1Q9BQP7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms