Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms