Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNDC1Q96C34 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms