Protein–RNA interactions for Protein: Q92538

GBF1, Golgi-specific brefeldin A-resistance guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBF1Q92538 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBF1Q92538 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms