Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms