Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCTD13Q8WZ19 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms