Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHDC9Q8NEP7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHDC9Q8NEP7 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms