Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ALYREFQ86V81 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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