Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TCF23Q7RTU1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms