Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.3 ms