Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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