Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC174Q6PII3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms