Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EEF1DP3Q658K8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms