Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
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COL24A1Q17RW2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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COL24A1Q17RW2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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COL24A1Q17RW2 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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COL24A1Q17RW2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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